現在最主要的應用是材料加工，占材料加工用激光器市場的7%左右，光纖激光器在材料加工中的份額仍將持續增長，但是假如光纖激光器要完全占據當前的材料加工、醫療診斷、信息科技和國防市場的話，仍舊需要很大的市場開發
 
       材料限制，雖然激光加工的應用范圍很廣，但是人又一定的的局限性，材料加工包含了很多不同的應用，每種應用都有自己的一套參數，但不是所有的參數光纖激光器都能做到。舉個例子，材料的微加工包括了所有的薄膜、光刻膠、半導體或金屬，這些都需要大范圍的激光參數，如脈沖、波長、平均功率水平等。另外，金屬板加工也包含了不同的厚度和材料、2D或3D操作、不同的速度要求。材料加工并非單一的市場。材料關系，有的產品的激光加工效果還不如普通加工。
 
       技術限制光纖激光器要被大范圍使用的話仍面臨著很多障礙。工業體系在不斷的發展，在平板切割領域，這是材料加工中最大的應用，光纖激光器使用一微米的波長切割薄板的時候表現出了它的優勢。但目前還不能采用惰性氣體輔助切割更薄的板，因為切割的結果不是很好。現在很多用戶喜歡用一臺加工機去加工各種材料，然而效果也可以預知，激光加工并不適合所有材料，這是光纖激光器被廣泛接納的障礙。
 
     雖然問題的解決依賴于對光纖激光器自身進行改變，也可以用其它工藝技術來彌補但是在某些脈沖機制下，光子暗化現象仍然是個大問題，解決起來并不容易。雖然面臨著如此多的難題，但是激光的材料加工市場也是一個很大的挑戰和機遇。